RNA病毒编码的依赖RNA的RNA聚合酶（RNA-dependentRNApolymerase，简称RdRP）是一类独特的核酸聚合酶，在病毒基因组复制和转录过程中发挥核心作用，是抗病毒药物研究的热点靶标。病毒的RdRP由于可与其他功能域融合或与其他病毒蛋白共折叠，其整体结构多样性较高，但其催化核心区的三维结构则较为保守，因此RdRP兼具多样性和保守性。由于RNA病毒的宿主范围几乎囊括了所有细胞形式的生命体，在与不同宿主的共同进化过程中，RdRP作为RNA病毒最保守的蛋白，其与病毒的宿主适应性之间的关联并不清晰。
黄病毒包括乙型脑炎病毒（Japaneseencephalitisvirus，简称JEV）、登革病毒（denguevirus，简称DENV）、寨卡病毒、蜱传脑炎病毒（tick-borneencephalitisvirus，简称TBEV）等多种人类致病病原，是一类分布广泛、种类繁多的单股正链RNA病毒，与丙型肝炎病毒和经典猪瘟病毒同属于黄病毒科。黄病毒大多由吸血节肢动物如蚊和蜱作为媒介传播，可引起人类脑炎或出血性疾病，对人类健康构成重大威胁。黄病毒的RdRP位于病毒编码的非结构蛋白NS5的羧基端，与氨基端的甲基转移酶（MTase）形成天然融合体。此前蚊传黄病毒的NS5已有多个三维结构报道，包括全长蛋白、MTase区和RdRP区的结构，而蜱传黄病毒NS5蛋白的全长结构及RdRP三维结构则未获解析。
中国科学院武汉病毒研究所研究员龚鹏团队长期从事病毒RdRP的催化与调控机制研究，此前已分别解析了JEV和DENV的NS5全长蛋白晶体结构（LuandGong,PLoSPathogens;Wuetal.,PLoSPathogens），并与武汉病毒所研究员张波团队合作，系统性揭示了NS5的构象多样性和保守性以及MTase调控RdRP的分子机制（Lietal.PLoSNeglectedTropicalDiseases;Wu,etal.JournalofVirology;Wuetal.,PLoSPathogens）。科研人员近期解析了分辨率为1.9埃的TBEVMTase晶体结构（PDB号7D6M，图1A）和分辨率为3.2埃的TBEVRdRP的晶体结构（PDB号7D6N，图1B），获得了首个蜱传黄病毒RdRP的三维结构信息。通过黄病毒RdRP的序列分析以及与结构已知的蚊传黄病毒RdRP的结构进行比较，发现在RdRP保守的催化基序（motif）B和C之间存在一个值得
图2.黄病毒科RdRPs中B-C连接区结构和序列的多样性。（A）第一排中TBEV属于蜱传黄病毒，其余属于蚊传黄病毒。第二排中TBEV和JEV属于黄病毒属，而HCV和CSFV分别属于黄病毒科中的肝炎病毒属和瘟病毒属。其中motifB、B-C连接区和motifC分别用黄色、橙色和浅绿色表示。（B）黄病毒NS5中B-C区域的序列比对。根据宿主的不同，黄病毒可以分为蚊传、蜱传、仅在昆虫中传播和仅在脊椎动物中传播四类。
图3.病毒种间B-C连接区替换突变影响病毒增殖。（A）（B）将连接区替换为JEV序列的TBEVNS5表现出与野生型聚合酶相似的依赖引物（A）和从头合成（B）活性。（C）（D）在细胞水平上TBEV和JEV的连接区替换突变体均不能实现病毒增殖。
图4.病毒RdRP的B-C连接区展现出较高的多样性。上中下三行分别为正链、负链和双链RNA病毒代表性RdRP的连接区结构。每个彩色结构分别代表一个RNA病毒科。其中B-C连接区用橙色显示。左侧为多结构叠印图（灰色）。
